事实上，胚胎融合与细胞融合，两者之间并未有本质上的区别，都是在自发或人工诱导下，两个不同基因型的细胞或原生质体融合形成一个杂种细胞，只是现在胚胎融合主要用于试管婴儿技术，而细胞融合是一种实验方法。
胚胎融合与细胞融合的区别：
一、胚胎融合
胚胎融合一般是用于试管婴儿的培育上，胚胎融合是指两个胚胎细胞融合共同发育成一个胚胎为嵌合胚胎。在自发或人工诱导下，利用两个不同基因型或原生质体融合形成一个杂种细胞，克服杂种胚的败育，获得稀有杂种;同时达到快速繁殖良种，缩短育种周期。
1、克服杂种胚的败育,获得稀有杂种;
2、快速繁殖良种,缩短育种周期;
3、克服生活力低下和自然不育性，提高胚胎怀孕率;
4、提高后代抗性,改良品质。
融合性胚胎是治疗不孕症的一种方法，通过试管婴儿技术给患者进行融合胚胎，其中胚胎融合是一种培养方法，只有经过这种培育，才能进行胚胎移植，融合胚胎就是桑葚胚，是囊胚的早期，是发育的一个阶段。
二、细胞融合
两个不同基因型的细胞或原生质体在自发条件或人工诱导下融合形成一种杂种细胞。其基本过程包括细胞融合导致异核体，异核体通过细胞有丝分裂进行核融合、最终形成单核的杂种细胞。细胞融合可以作为一种试验方法，广泛应用于单克隆抗体的制备和膜蛋白的研究中。
细胞融合的定义：
在有性繁殖过程中发生的精卵结合是正常的细胞融合，即两个配子融合形成新的二倍体。细胞融合是一个在自然条件下或通过人工方法(生物、物理、化学)将两个或两个以上的细胞合并形成一个细胞的过程。
其中，人工诱导的细胞融合不仅能产生同样的细胞融合，还能产生种间细胞的融合，细胞融合技术目前广泛应用于细胞生物学和医学研究的各个领域。同一基因型细胞融合的杂交细胞称为同核体;不同基因型的杂交细胞称为异核体。
细胞融合的过程：
细胞膜由内、外两层组成，细胞融合首先发生在细胞外层，再到内层，由此产生两种融合通道，即细胞内的物质通过这两个通道转移。当病毒膜与目标细胞融合时，产生融合的基因仅存在于病毒中，而在目标细胞中则没有试管婴儿。但通过EFF-1发生的细胞融合是一个双向的融合过程，需要EFF-1在两个融合细胞中出现。
细胞融合的意义：
1、从理论上讲，任何细胞，都可以通过体细胞杂交成为新的生物资源。对种质资源的开发利用具有深远的意义;
2、融合过程不存在有性杂交过程中的种性隔离机制的限制，为远缘物种间的遗传物质交换提供了一条有效的途径;
3、体细胞杂交产生的杂种细胞含有双亲核外遗传系统，如叶绿体、线粒体 DNA在杂种分裂和增殖过程中同样可以重组，从而产生新的核外遗传系统;
4、淋巴细胞杂交瘤和单克隆抗体的制备。
