试管婴儿医院的选择也是影响试管婴儿成功率的重要因素之一，对于考虑做试管的患者来说，选择一家正规的做试管婴儿的医院，不管是从医院的技术水平，还是医生的专业水平来说，都会更有保障。
浙江省舟山市目前可以开展试管婴儿技术的医院只有一家，即舟山市妇幼保健院，该院生殖中心目前可运行第一代试管婴儿以及第二代试管婴儿技术，试管的成功率已达到国内平均水平，该市暂无其他的医院具备开展人类辅助生殖技术的资质。
舟山市妇幼保健院（妇女儿童医院）是一家集医疗、保健、科教为一体的三级甲等妇幼保健院，是舟山市妇女儿童医疗保健中心，是国家级爱婴医院、国家级母婴友好示范医院，上海市红房子妇产科医院技术协作单位，舟山市危重孕产妇救治中心、舟山市危重新生儿救治中心，是浙江省急救基层卫生适宜技术示范基地、浙江省妇女儿童基层卫生适宜技术示范基地，浙江省妇产科、儿科住院医师规培基地、儿童早期综合发展省级示范基地。
该院是浙江省为数不多具有合法开展人类生殖辅助技术的医院之一。该院的生殖中心是浙江省对口支援省市共建医学重点学科，中心建有舟山唯一的男性精子功能实验室，开展人工授精辅助生育技术、试管婴儿技术等，目前辅助生育妊娠率达57%左右，已顺利诞生100多个“试管宝宝”，位于省内先进水平。
舟山市妇幼保健院的生殖医学中心成立于2001年，是浙江省第一批准入开展夫精人工授精技术的中心之一，是舟山市首批医学重点学科，省级医疗卫生单位对口支援市级医学重点学科。
2014年9月中心开展人类辅助生殖技术，体外受精-胚胎移植（第一代试管婴儿）、卵胞浆内单精子显微注射（第二代试管婴儿）等技术试运行，2015年9月获准正式开展。中心建筑面积650㎡，配备了国内一流的临床和实验室配套设施试管婴儿，满足生殖中心临床和辅助生殖技术服务的需要。
