巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位囊肿，是由子宫内膜异位症引起的一种疾病。由于子宫内膜异位症，子宫内膜碎片在月经期间进入卵巢或盆腔，形成囊肿。
子宫内膜通常生长在子宫腔的内部表面，覆盖着宫腔，为受精卵提供着床。而且子宫内膜异位，是指子宫内膜异常生长到子宫腔内表面之外，如最常见的卵巢、盆腔、腹膜、肠表面等。异常子宫内膜还具有正常子宫内膜的功能特征，每次月经来潮时都会被剥脱而出血。
卵巢上的异位子宫内膜则生长在卵巢上，每一次月经都会被剥脱出血，然后卵巢修复，周围发炎粘连，逐渐形成囊腔，随着出血的增多，囊腔内就会氧化成巧克力样粘稠物。卵巢内囊肿增大，卵巢皮质受到压迫，使其变薄，破坏卵泡正常发育，干扰生殖内分泌，进而影响排卵。巧囊可能会破裂，导致囊内液体漏出，与周围输卵管肠紧密粘连，影响输卵管的形态和功能，干扰输卵管的拾卵功能。
那有什么治疗巧克力囊肿的方法？
1、药物治疗。药物治疗一般分为中医治疗和西医治疗。如果囊肿位于卵巢内，由于卵巢与肝经有关，所以囊肿的形成与肝气郁结有关，一般通过外敷药物调理气血，消散郁结，活血止痛，达到治标治本的目的。西医的主要做法是性激素疗法，通过抑制雌激素的产生，减少巧克力囊肿形成的子宫内膜，从而达到治疗巧克力囊肿的目的。
2、手术治疗。手术治疗常用于病情较重，用药无明显疗效的患者。在巧克力囊肿直径达3cm时，应及时进行手术，避免囊肿破裂，尽可能地保留卵巢组织，术后需服避孕药以防止囊肿复发。
3、放射治疗。又被称为姑息治疗，用于术后的辅助治疗，或用于不能手术的患者，但有一些副作用，要小心，以免给卵巢带来额外的创伤。
有资料表明，巧囊患者不孕的机率约为40％，巧克力囊肿不仅影响卵泡的正常发育，而且影响女性生殖系统的正常分泌巧克力囊肿，所以巧克力囊肿是有可能会导致发生不孕的。
